Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFEMP1Q12805 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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