Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms