Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD47Q08722 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD47Q08722 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms