Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms