Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LOXL1Q08397 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms