Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHX9Q08211 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms