Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLEQ07864 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLEQ07864 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLEQ07864 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLEQ07864 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLEQ07864 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLEQ07864 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms