Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms