Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms