Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms