Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms