Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms