Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREMQ03060 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREMQ03060 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREMQ03060 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREMQ03060 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREMQ03060 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREMQ03060 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREMQ03060 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms