Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms