Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms