Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms