Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms