Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms