Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NOMO3P69849 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NOMO3P69849 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NOMO3P69849 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOMO3P69849 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms