Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms