Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW4P57775 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms