Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms