Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DAP3P51398 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DAP3P51398 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.5 ms