Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP4P49662 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP4P49662 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP4P49662 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP4P49662 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP4P49662 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP4P49662 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP4P49662 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP4P49662 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP4P49662 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP4P49662 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP4P49662 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms