Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP5P45974 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP5P45974 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP5P45974 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP5P45974 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP5P45974 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP5P45974 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP5P45974 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms