Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR4A2P43354 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms