Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms