Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms