Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL9P32969 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL9P32969 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms