Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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