Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFP26441 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFP26441 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNTFP26441 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNTFP26441 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFP26441 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFP26441 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFP26441 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms