Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms