Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCM3P25205 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCM3P25205 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCM3P25205 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCM3P25205 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms