Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSP16219 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSP16219 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms