Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms