Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIMD1P0DJR0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIMD1P0DJR0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms