Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P2

RFPL3S, Putative protein RFPL3S, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3SP0C7P2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL3SP0C7P2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms