Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms