Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVILO95425 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVILO95425 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms