Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL41O60662 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms