Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms