Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENRO43583 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms