Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASA4O43374 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASA4O43374 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASA4O43374 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASA4O43374 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASA4O43374 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASA4O43374 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASA4O43374 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASA4O43374 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RASA4O43374 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASA4O43374 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASA4O43374 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASA4O43374 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASA4O43374 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASA4O43374 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASA4O43374 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASA4O43374 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms