Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms