Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2SURPO15042 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms