Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL2O00472 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL2O00472 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL2O00472 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL2O00472 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL2O00472 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms