Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A7O00341 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A7O00341 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms