Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WASHC1A8K0Z3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms