Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms