Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSDA5PKW4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms